Program Doktoral Ilmu Ekonomi Universitas Trisakti, memiliki 3 Konsentrasi:

1. Ilmu Akuntansi

2. Ekonomi Pembangunan

• Sustainable Development
• Ekonomi dan Keuangan Islam
• Kebijakan Publik

3. Manajemen

• Pemasaran
• Stratejik
• Keuangan
• SDM
• Jasa