Program Doktoral Ilmu Ekonomi Universitas Trisakti, memiliki 3 Konsentrasi:

1. Ilmu Akuntansi

• Akuntansi

2. Ilmu Ekonomi

• Sustainable Development
• Ekonomi dan Keuangan Syariah
• Kebijakan Publik

3. Ilmu Manajemen

• Jasa
• Keuangan
• Pemasaran
• SDM
• Stratejik