Program Doktoral Ilmu Ekonomi Universitas Trisakti, memiliki 3 Konsentrasi:

1. Ilmu Akuntansi

2. Ilmu Ekonomi

• Sub Konsentrasi Sustainable Development
• Sub Konsentrasi Ekonomi dan Keuangan Islam
• Sub Konsentrasi Kebijakan Publik

3. Ilmu Manajemen

• Sub Konsentrasi Pemasaran
• Sub Konsentrasi Stratejik
• Sub KonsentrasiKeuangan
• Sub Konsentrasi SDM
• Sub Konsentrasi Jasa